Áreas de Trabajo
El enfoque del laboratorio es en enfermedades emergentes y reemergentes causadas por virus de ARN, principalmente coronavirus y arbovirus. Un aspecto importante de nuestro trabajo es la genómica y metagenómica viral y el estudio de la evolución viral usando métodos filogenéticos y filodinámicos, en colaboración con el sector salud. También estudiamos la virología e inmunología clínica de virus de ARN, usando cohortes clínicas de pacientes para entender la historia natural de las infecciones y cómo ésta se ve modulada por vacunas, re-infecciones y otros factores. Tenemos un gran interés por utilizar observaciones clínicas y evolutivas para entender procesos básicos de la relación huésped-patógeno. Usamos secuenciación masiva, cultivo celular y viral, citometría de flujo, técnicas básicas en virología en el laboratorio de bioseguridad nivel II y III, entre otras técnicas, para abordar los objetivos de los proyectos del laboratorio.
Proyectos en curso:
1. Diversidad de los viromas de mosquitos en diferentes nichos ecológicos. Los mosquitos albergan un conjunto de virus, el viroma, conformados por arbovirus, y mayormente, virus específicos de insectos (VEI). Estudios recientes indican que los VEI pueden modular la susceptibilidad de los mosquitos a arbovirus como Zika y Dengue. Este proyecto busca identificar factores que modulan la diversidad del viroma de mosquitos Aedes y Culex en México y en Uganda y caracterizar la respuesta inmune del mosquito hacia diferentes tipos de VEI. El proyecto es un proyecto piloto de la red de Centers for Research in Emerging Infectious Diseases Network (CREID).
2. Caracterización de la amplitud de la respuesta de anticuerpos neutralizantes hacia variantes emergentes de SARS-CoV-2. Hay múltiples interrogantes acerca de la duración y de la capacidad neutralizante de la respuesta de anticuerpos hacia variantes de escape de SARS-CoV-2. En particular, sabemos poco acerca de cómo influye el historial de infección y de vacunación en la amplitud de la respuesta de anticuerpos neutralizantes (AcN). Mediante colaboraciones clínicas y estudios transversales, buscaremos monitorear la respuesta de AcN en grupos de individuos que hayan recibido refuerzos vacunales recientes y en personas con infecciones recientes.
Publicaciones Recientes
Kelly, J.D., Lu, S., Anglin, K., Garcia-Knight, M., et al.
Magnitude and determinants of SARS-CoV-2 household transmission: a longitudinal cohort study.
Clin Infect Dis. 2022 Oct 3;75(S2):S193-S204
2022
Tassetto, M.*, Garcia-Knight, M.*, Anglin, K.*, et al.
Detection of Higher Cycle Threshold Values in Culturable SARS-CoV-2 Omicron BA.1 Sublineage Compared with Pre-Omicron Variant Specimens – San Francisco Bay Area, California, July 2021-March 2022.
MMWR Morb Mortal Wkly Rep. 2022 Sep 9;71(36):1151-1154
2022
Garcia-Knight, M., Anglin, K., Tassetto, M., Lu, S., et al.
Infectious viral shedding of SARS-CoV-2 Delta following vaccination: a longitudinal cohort study.
PLoS Pathog.2022 Sep 12;18(9):e1010802
2022
Deng X*, Garcia-Knight MA*, Khalid MM*, et al.
Transmission, infectivity, and neutralization of a spike L452R SARS-CoV-2 variant.
Cell. 2021 Jun 24;184(13):3426- 3437.e8
2021
Tassetto M, Kunitomi M, Whitfield ZJ, Dolan P, Sánchez-Vargas I, Garcia Knight M, et al.
Control of RNA viruses in mosquito cells through the acquisition of vDNA and endogenous viral elements.
eLife 2019;8:e41244 doi: 10.7554/eLife.41244
2019
Lista de publicaciones completa en: https://bit.ly/3ZUMgdD
Estudiantes
Nombre | Nivel |
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Andrea Citlalli Urrutia Schroeder | Licenciatura |
Sandra Naitzé Martínez Byer | Licenciatura |
Zyanya Izcaltik Velázquez López | Licenciatura |
Uriel Juárez Olivares | Licenciatura |